죽상경화반 미세환경의 공간 단백체 이질성
죽상경화반의 이질성은 심혈관 질환을 유발하는 병변 파열의 주요 원인으로 알려져 있습니다. 기존 단백체 연구는 주로 전체적인 변화에 초점을 맞춰, 단백질 풍부도의 핵심적인 공간적 차이를 간과하는 경향이 있었습니다. 본 연구는 인체 플라크 및 쥐 심근의 분자 지형을 탐색하기 위한 고해상도 공간 단백체 분석 워크플로우를 제시합니다. 레이저 포획 미세해부와 고감도 이온 이동성 질량 분석법을 결합하여 세포 및 세포외 기질(ECM) 단백체의 공간적 프로파일링을 성공적으로 수행했습니다. 50,000 μm2 면적에서 2,700개 이상의 단백질이 검출되었으며, 이는 죽상경화반 내 다양한 영역(지질-풍부, 중막, 어깨, 괴사성 핵, 내막)과 동맥 내강으로부터의 거리에 따른 상당한 이질성을 보여주었습니다. 프로테아제(카텝신 B)와 핵심 구조적 ECM 단백질(펄레칸, HSPG2) 간의 역 상관관계는 활발한 ECM 리모델링을 시사했습니다. 중막층 분석에서는 평활근 수축 및 세포-세포 통신과 관련된 독특한 단백질 특징이 나타났습니다. 내막에서는 혈소판 탈과립 및 피브린 형성을 포함한 혈액 응고 특징이 풍부하게 발견되었고, 어깨 부위에서는 염증(CD4/CD68, VCAM1) 및 혈관 손상 마커(테나신-C)가 농축되었습니다. 괴사성 핵은 혈관 내 출혈과 일치하게 혈액 단백질이 지배적이었습니다. 본 워크플로우는 약 200 μm 거리에서 단백체 변화를 해결하여 플라크 형태에 대한 전례 없는 통찰력을 제공하며, 플라크 생물학을 규명하는 강력한 도구로 활용될 수 있습니다.