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질량 분석

2편의 한국어 분석 — 최신순으로 정렬했어요

화학발표 2026.10· 3최근 1년 3회

식물 미토콘드리아 프로테옴 고신뢰도 분석

식물 미토콘드리아는 동물과 유사한 특징 외에 환형/선형 미토콘드리아 DNA, RNA 편집, 분지형 전자전달계 등 고유한 특성을 지닌다. 이러한 보존 및 계통 특이적 기능을 연구하기 위해서는 정확한 미토콘드리아 프로테옴 정보가 필수적이다. 본 연구는 직렬 미토콘드리아 농축, 질량 분석, 단백질 상관관계 프로파일링을 결합한 새로운 접근법을 통해 식물 미토콘드리아 프로테옴을 규명했다. 이 방법을 활용하여 1,462개의 미토콘드리아 단백질 목록을 높은 민감도와 특이도로 실험적으로 정의했다. 실험 데이터와 기존 문헌 및 현미경 검증을 통합하여 1,609개 미토콘드리아 단백질을 포함하는 아라비돕시스 탈리아나 미토카르타(AtMitoCarta) 아틀라스를 구축했다. 여기에는 236개의 신규 단백질과 147개의 기능 미상 단백질이 포함된다. 진핵생물 간 비교 분석 결과, 15%의 미토콘드리아 단백질 패밀리가 식물 특이적이며, 펜타트리코펩타이드 반복 단백질의 확장이 관찰되었다. 이 AtMitoCarta 목록과 야생형 식물에 적용 가능한 실험 워크플로우는 식물 미토콘드리아에 대한 비교 연구를 가능하게 하여 관련 분야 발전에 기여할 것이다.

화학발표 2026.09· 2최근 1년 2회

mRNA 및 단백질 이형체 통합 분석

대체 스플라이싱과 단백질 분해는 단일 유전자에서 다양한 단백질 이형체를 생성하여 프로테옴 다양성을 확장합니다. 그러나 기존 단백질체학 방법론의 한계로 인해 전사체 이형체와 단백질 산물 간의 관계는 아직 명확히 밝혀지지 않았습니다. 본 연구에서는 인간 RPE-1 세포에서 mRNA 및 단백질 이형체의 통합 지도를 구축하기 위해, 전체 길이 mRNA 시퀀싱을 단백질 분획 및 정량적 질량 분석법과 결합했습니다. 특히, 바텀업 단백질체학의 모호성을 극복하고자 분자량으로 분리된 펩타이드 이동 프로파일로부터 단백질 이형체를 해석하는 전산 파이프라인인 IsoFrac을 개발했습니다. 이 접근법을 통해 약 45,000개의 전체 길이 전사체, 약 32,000개의 ORF, 그리고 약 14,000개의 단백질 이형체 후보를 식별했습니다. 비교 분석 결과, 대체 전사체의 광범위한 번역이 확인되었으며, 단백질 분해 또는 대체 번역으로 인해 발생하는 짧은 단백질 변형체가 프로테옴 복잡성의 주요하고 간과되었던 원천임을 밝혀냈습니다. 본 연구 결과는 이형체 단위의 프로테오게놈 분석을 위한 확장 가능한 프레임워크를 제시하며, 단백질 이형체 다양성 연구를 위한 중요한 자료를 제공합니다.

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