수마트라 고유종 Hemibagrus velox 미토유전체 분석

인도네시아 수마트라 고유종인 Bagridae 과 메기 Hemibagrus velox는 분자 증거 부족으로 분류학적 불확실성이 존재합니다. 최근 미토유전체 접근법의 발전은 이러한 모호성을 해결하는 데 강력한 틀을 제공하며, 본 연구는 H. velox의 완전한 미토유전체 특성을 규명하고, 동종 간 유전자 구조 및 변이를 비교 분석하며, Bagridae 내 계통발생학적 위치를 평가하는 것을 목표로 합니다. H. velox의 미토유전체는 16,512 bp 크기로 37개 유전자, 비번역 조절 영역(CR), 58.09%의 A+T 편향, 11개 유전자간 스페이서, 6개 중복 영역으로 구성됩니다. 대부분의 단백질 코딩 유전자(PCG)는 ATG 개시 코돈을 사용했으나, COI 유전자는 GTG를 사용했습니다. 아미노산 조성 분석 결과 류신, 세린, 아르기닌이 풍부했으며, 메티오닌과 트립토판은 가장 적었습니다. 비동의 치환 대 동의 치환 비율은 Hemibagrus 종 PCG에 작용하는 강한 정화 선택을 나타냈습니다. 21개 tRNA의 2차 구조는 tRNA-Ser(S1)을 제외하고는 전형적인 클로버잎 구조를 보였습니다. 8개 Hemibagrus 종의 CR 내 보존 서열 블록 비교 분석 결과 길이와 뉴클레오타이드 조성에 변이가 있었으며, H. guttatus에서만 확장된 종결 관련 서열 영역 내에 반복 서열이 발견되었습니다. 베이즈 추론, 최대우도, 근린결합 방법을 사용한 계통발생 분석은 Hemibagrus가 Bagridae 과 내에서 단일 계통군이 아님을 보여주었습니다. 종합적으로, 본 연구는 H. velox와 7개 동종에 대한 상세한 유전적 특성화를 제공합니다. 추론된 모계 진화 패턴은 이전 가설을 더욱 강화하며, Bagridae 과의 분류학적 재평가에 중요한 분자적 증거를 제시합니다.