타액 단일세포 단백질체 분석으로 구강암 비침습 세포 프로파일링

단일세포 단백질체학(SCP)은 상당한 발전을 이루었지만, 여전히 균질한 세포 집단에 주로 제한되며 임상 적용과는 거리가 있습니다. 본 연구는 타액 및 눈물액 내 세포 이질성을 평가하기 위한 SCP 워크플로우를 제시합니다. 표준 HeLa 소화 곡선을 사용하여 50pg에서 5,463개 이상의 단백질 그룹(PGs)을 검출하며 벤치마크를 확립했습니다. 단일 HeLa 세포의 경우, 오염을 최소화하고 정량 성능을 높여 단일 세포당 최대 3,785개의 PGs를 검출하도록 워크플로우를 개선했습니다. 이후 10명의 건강한 개인으로부터 수집한 타액 및 눈물액의 이질적인 세포 집단에 SCP를 적용하여 벤치마크를 수행했습니다. 세포 분리, 오염 제어 및 DIA 기반 검색 및 정량법을 개선함으로써, 평균 직경 8µm인 타액 단일 세포(n=110)와 평균 직경 11µm인 눈물액 단일 세포(n=149)에서 단일 세포당 최대 700개의 PGs를 얻었습니다. 후속 분석 결과, 과대표된 단백질 기능, 뚜렷한 클러스터 마커, 그리고 단일세포 데이터에서 식별된 23개의 검증된 치료 표적을 확인했습니다. 본 연구는 생체액에 적용된 SCP 워크플로우의 견고성을 입증하며, 복잡한 미세 환경에서 바이오마커 및 치료 표적 발굴을 촉진합니다.