pyXLMS: 교차결합 질량분석 결과 통합 분석

교차결합 질량분석법은 단백질-단백질 상호작용 규명 및 생체 내 단백질 구조 분석에 필수적인 방법으로 자리매김했습니다. 그러나 교차결합 검색 엔진 결과와 후속 분석 도구를 연결하여 생물학적 통찰력을 얻는 과정은 수동적이고 번거로워, 종종 전문적인 생물정보학 지식을 요구하는 어려움이 있었습니다. 이러한 중간 단계를 간소화하고 효율화하기 위해 Python 패키지이자 웹 애플리케이션인 pyXLMS를 개발했습니다. pyXLMS는 생물정보학 지식이 없는 연구자도 심층적인 교차결합 분석을 수행할 수 있도록 지원합니다. 현재 7개 이상의 교차결합 검색 엔진 및 HUPO Proteomics Standards Initiative의 mzIdentML 형식을 지원합니다. pyXLMS는 집계, 유효성 검사, 주석 달기, 필터링, 시각화 등 데이터 처리 및 품질 관리를 위한 다양한 기능을 직접 제공합니다. 또한, 10개 이상의 후속 분석 도구 및 형식으로 데이터를 쉽게 내보낼 수 있습니다. 본 연구에서는 공개된 교차결합 데이터셋을 다양한 검색 엔진으로 재분석하여 pyXLMS의 적용 가능성과 이점을 입증했습니다. 이를 통해 동일한 데이터 분석 워크플로우를 pyXLMS로 효율적으로 적용할 수 있음을 보여주었습니다.