난소암 병기별 단백체 변화 및 바이오마커
난소암은 치사율이 높고 효과적인 바이오마커가 부족한 치명적인 부인과 악성 종양입니다. 예측, 예방 및 개인 맞춤 의학(PPPM) 개념은 조기 경보 시스템과 맞춤형 개입의 필요성을 강조하며, 신뢰할 수 있는 병기별 바이오마커에 대한 수요를 높이고 있습니다. 본 연구에서는 데이터 독립적 획득(DIA) 질량 분석법을 사용하여 병기 I-IV의 난소암 조직 60개와 양성 난소 조직 17개의 포괄적인 단백체 분석을 수행했습니다. 또한, 이러한 단백체 분석 결과를 TCGA/GTEx 데이터와 통합하여 생존 분석 및 핵심 분자를 식별한 후, 웨스턴 블롯 및 다중 면역조직화학법으로 실험적 검증을 진행했습니다. 총 1,669개의 차등 발현 단백질(DAP)이 각 병기(I, II, III, IV)에서 대조군과 유의미한 차이를 보였습니다. 초기 병기(I-II)의 DAP는 주로 세포 주기 과정 및 염색체 분리와 같은 세포 증식 관련 생물학적 과정에 풍부하게 존재했으며, 진행성 병기(III-IV)의 DAP는 세포외 기질(ECM) 조직화 및 세포 부착을 포함한 경로에 주로 풍부했습니다. 트렌드 클러스터 분석을 통해 6가지 유형의 트렌드 클러스터가 확인되었고, PPI 네트워크 분석으로 28개의 허브 단백질이 식별되었습니다. 특히, 허브 단백질 SMC2는 핵에 위치하며 초기 병기(I/II) 동안 상향 조절되었습니다. 이는 TCGA/GTEx, 웨스턴 블롯 및 다중 면역형광 분석에서 난소암 조직 내 mRNA 및 단백질 수준이 유의하게 상향 조절되었으며, Kaplan-Meier 생존 분석 결과 전체 생존율 감소와 유의미한 관련성(HR = 1.31, 95% CI: 1.12–1.55, p = 0.0011)을 보였습니다. 본 연구는 난소암의 대규모 병기별 단백체 아틀라스를 제공하며, 세포 주기 및 게놈 안정성을 조절하는 28개 단백질 핵심 모듈을 식별했습니다.