4편의 한국어 분석 — 최신순으로 정렬했어요
질량분석기반 단일세포 단백질체학(SCP)은 세포 이질성, 생물학적 과정, 질병 메커니즘 이해에 필수적입니다. 그러나 기존 나노LC-MS 워크플로우는 긴 분석 시간과 낮은 처리량으로 인해 대규모 코호트 적용에 한계가 있었습니다. 본 연구에서는 다중 컬럼 나노LC-MS 플랫폼을 개발하여 5분 분리 시간과 100% 듀티 사이클을 달성했습니다. 이를 통해 하루 최대 288개의 단일 세포를 분석할 수 있으며, 약 1200회 연속 주입에도 안정적인 펩타이드 분리, 미미한 오염, 뛰어난 재현성을 보였습니다. 이 플랫폼은 하루 약 288개 샘…
법의학 분야에서 미지의 생물학적 시료에 대한 출처 생물 특성 분석은 중요하나, 프로테오믹스 데이터 분석 적용에는 한계가 있었습니다. 본 연구는 이러한 간극을 해소하고자 새로운 계산 도구인 MARLOWE를 개발했습니다. MARLOWE는 de novo 펩타이드 시퀀싱을 통해 얻은 펩타이드 태그와 광범위한 서열 데이터베이스 기반의 통계적 접근 방식을 활용하여 잠재적 출처 생물 목록을 제공합니다. MARLOWE는 사전 지식 없이 펩타이드를 분류학적으로 할당하고 점수를 매기는 확률론적 방식을 채택하여 편향 없는 결과를 도출합니다. 개념 증…
인산화는 세포 신호 전달 및 질병 메커니즘에 필수적인 번역 후 변형(PTM)이다. 질량 분석 기반 인산화단백질체학은 인산화 이벤트를 전사적으로 특성화하는 데 널리 사용되지만, 인산화 부위의 정확한 위치 파악, 복잡한 검색 공간, 그리고 참조 데이터베이스 외 서열 검출에 어려움이 있다. 기존 방법의 한계를 극복하기 위해, 새로운 펩타이드 서열 분석(de novo peptide sequencing) 기술의 발전이 요구된다. 본 연구에서는 이러한 한계를 해결하고자 트랜스포머 기반 InstaNovo 모델의 인산화 특이적 버전인 Insta…
질량 분석법(MS) 기반 프로테오믹스 분야에서 개방형 데이터 표준화를 목표로 설립된 ProteomeXchange 컨소시엄은 지난 3년간 상당한 발전을 이루었습니다. PRIDE, PeptideAtlas, MassIVE, jPOST, iProX, Panorama Public 등 3개 대륙에 걸쳐 있는 6개 회원 데이터베이스를 통해 데이터 제출 건수가 매년 가속화되고 있습니다. 2025년 6월까지 ProteomeXchange 리소스에 총 64,330개의 데이터셋이 제출되었으며, 이 중 30,097개(47%)가 지난 3년 동안 제출되었습…
