프로테옴엑스체인지 컨소시엄: FAIR한 프로테오믹스 데이터

질량 분석법(MS) 기반 프로테오믹스 분야에서 개방형 데이터 표준화를 목표로 설립된 ProteomeXchange 컨소시엄은 지난 3년간 상당한 발전을 이루었습니다. PRIDE, PeptideAtlas, MassIVE, jPOST, iProX, Panorama Public 등 3개 대륙에 걸쳐 있는 6개 회원 데이터베이스를 통해 데이터 제출 건수가 매년 가속화되고 있습니다. 2025년 6월까지 ProteomeXchange 리소스에 총 64,330개의 데이터셋이 제출되었으며, 이 중 30,097개(47%)가 지난 3년 동안 제출되었습니다. 이는 데이터 공유 및 활용에 대한 관심이 지속적으로 증가하고 있음을 보여줍니다. 컨소시엄은 Proteomics Standards Initiative가 개발한 Universal Spectrum Identifiers 및 SDRF(Sample and Data Relationship Format)-Proteomics와 같은 표준 지원을 강화했습니다. 또한, 공개 데이터셋의 재활용 활동이 활발해졌습니다. 다양한 프로테오믹스 데이터 유형의 표적 재분석과 새로운 머신러닝 접근법 개발이 그 예시입니다. 이는 데이터의 가치와 활용도를 높이는 데 기여하고 있습니다. 향후 ProteomeXchange는 통제 접근 방식의 인체 프로테오믹스 데이터 리소스 개발과 비-MS 프로테오믹스 접근법 지원을 계획하고 있습니다. 이를 통해 프로테오믹스 데이터의 FAIR(Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) 원칙을 더욱 확고히 하고, 연구 커뮤니티에 기여하고자 합니다.