침습성 비장티푸스성 살모넬라(iNTS) 질환은 개발도상국의 주요 공중 보건 위협이지만, 가나의 분자 역학 데이터는 여전히 제한적입니다. 이 연구는 가나에서 분리된 iNTS 균주의 계통유전체 프로파일과 항생제 내성 결정 요인을 특성화했습니다.
2016년부터 2023년까지 8년간의 감시 기간 동안, 총 271개 세균 병원체 중 31개의 iNTS 혈액 배양 분리주를 전장 유전체 시퀀싱했습니다. 유전체 데이터를 통해 혈청형 분포, MLST 프로파일, 항균제 내성 유전자, 그리고 플라스미드 및 살모넬라 병원성 섬(SPI)을 포함한 독성 표지자를 분석했습니다.
S. Typhimurium과 S. Enteritidis가 가나에서 순환하는 iNTS 분리주의 67.7%를 차지했습니다. S. Typhimurium ST 313 균주는 사하라 이남 아프리카의 침습성 질환과 관련된 L2 및 L3 계통이었고, S. Enteritidis ST 11 분리주는 전 세계적 유행 및 중앙 동아프리카 클러스터와 일치했습니다. 모든 iNTS 분리주는 침습성과 관련된 여러 SPI를 보유했으며, 77.4%는 플라스미드를 가졌습니다.
분리주의 거의 절반(48.8%)이 하나 이상의 항생제 내성 유전자를 보유했으며, 약 30%는 3가지 이상의 항생제 계열에 대한 내성을 부여하는 다중 항생제 내성 유전자를 가졌습니다. 가장 흔한 항생제 내성 유전자는 베타 락타마제 효소를 코딩하는 blaTEM-1 유전자였습니다. 본 연구 결과는 가나 iNTS의 진화 및 항생제 내성 확산에 대한 중요한 통찰력을 제공합니다.
사하라 이남 아프리카 지역은 세계보건기구(WHO) 지정 주요 병원균 및 ESKAPE 세균에 대한 감시 데이터가 부족하여 지역사회 전파 위험이 높다. 본 연구는 나이지리아 곰베주 가정 하수를 대상으로 주요 병원균 검출 및 항생제 내성 평가를 최초로 수행하여, 임상적으로 중요한 병원균에 초점을 맞췄다.
곰베주 7개 지역 320개 가정 하수 샘플에서 다단계 샘플링을 통해 WHO 지정 주요 병원균을 감시했다. 특히 그람 음성 병원균인 Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter spp.를 분리 및 특성화했다. 항생제 감수성 테스트는 CLSI 2024 가이드라인에 따라 12가지 항생제를 대상으로 진행했으며, ESBL 및 카바페네마제 유전자(blaVIM, blaKPC, blaCTX-M)는 PCR로 확인했다.
주요 병원균 중 E. coli(32.6%), K. pneumoniae(19.2%), P. aeruginosa(11.2%) 순으로 검출되었다. P. aeruginosa는 73.3%의 다제내성(MDR)을 보였고, 카바페네마제 유전자(blaVIM 60%, blaKPC 20%)가 검출되었다. K. pneumoniae는 79.2%의 MDR 유병률과 ESBL 생성균에서 blaCTX-M 유전자 100%를 나타냈다. E. coli는 84.7%의 MDR과 51.5%의 ESBL 생성을 보였다.
본 연구 결과는 나이지리아 곰베주 가정 하수 내 심각한 항생제 내성 병원균의 확산 실태를 밝혀냈다. 이는 지역사회 감염 위험을 줄이고 공중 보건을 보호하기 위한 효과적인 감시 및 개입 전략 수립의 중요성을 강조한다.
